Journal of Animal Environmental Research

fa ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه بندی ارقام کلزا با نشانگرهای مولکولی و صفات رشدی Evaluation of Genetic Diversity and Grouping of Rapeseed Cultivars using Molecular Markers تخصصي Special پژوهشي Research <div style="text-align: justify;">مقدمه: کلزا (Brassica napus) به عنوان یک گیاه دانه روغنی با ارزش در سراسر جهان کشت میشود آگاهی از پراکندگی ژنوتیپ ها در تعیین روش حفاظت آن ها نقش مهمی ایفا می کند. نشانگرRAPD  به عنوان یک روش ارزان و سریع و بدون نیاز به اطلاعات اولیه ژنوم، یکی از پرکاربردترین نشانگرهای مولکولی در تعیین روابط فیلوژنتیکی و تمایز گونه های مختلف جانوری و گیاهی می باشد. مواد و روش ها: تعداد ۲۵ ژنوتیپ مهم کلزا مورد کشت در مناطق مختلف کشور پس از آمادهسازی خاک، در شرایط گلخانه در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار کشت شدند. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و پس از استخراج DNA از برگ واکنش زنجیرهای پلیمراز با آغازگرهای RAPD انجام گردید. تعداد و درصد جایگاه‌های چندشکلی، ضریب تشابه ژنتیکیNei ، شاخص تنوع ژنتیکی، تعداد آلل موثر و شاخص اطلاعات شانون توسط نرم‌افزار POPGEN V1.31 و تجزیه و تحلیل خوشه ای توسط نرم افزار NTSYS V2.02 مورد ارزیابی قرار گرفت. تجزیه واریانس تعداد 16 شاخص رشدی اندازه گیری شده و مقایسه میانگین داده ها، همبستگی بین صفات، تجزیه خوشه ای و محاسبه ضریب کوفنتیک با نرم افزارهای V.9.4 SAS،SPSS V. 22 و NTYSIS صورت گرفت. نتایج: تعداد 83 باند چندشکل تکثیر شد، بیش ترین و کم ترین تعداد باند چند شکل به ترتیب در آغازگر شماره 6 و آغازگرهای شماره 5 و 8  مشاهده گردیدند. محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) از 0/21 تا 0/5 و میزان تنوع ژنتیکی نی از 0/2 تا 0/36 متغیر بود. تجزیه خوشهای به روش UPGMA و ضریب جاکارد با همبستگی کوفنتیک 0/67 ژنوتیپ ها را در سه گروه مجزا قرارداد. ژنوتیپ های قرار گرفته در گروه یک  و سه به ترتیب ارقام بهاره و زمستانه می باشند. اکثریت ارقام قرار گرفته در گروه دوم (84 درصد) با منشا فرانسه، آلمان، استرالیا، ایران و صربستان می باشند. کم ترین فاصله ژنتیکی بین ژنوتیپهای آلنسو و ناتالی مشاهده گردید. تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که مؤلفه اول و دوم 81/02 درصد از تنوع به دست آمده را توجیه می کنند، که نشان دهنده توزیع مناسب آغازگرهای مورد بررسی بر روی ژنوم میباشد. تجزیه خوشه ای به روش UPGMA، این ژنوتیپ ها را به چهار گروه مجزا تقسیم نمود. همبستگی بین دو صفت تعداد روز تا گلدهی و تعداد روز تا ساقه دهی برابر ۱، مثبت و در سطح احتمال ۱ درصد معنی دار بود. بحث و نتیجه گیری: از آن جاکه رقم زوریکا عملکرد دانه و روغن بالا دارد می توان از این ژنوتیپ در برنامه های تلاقی با ارقام ایرانی استفاده کرد.</div> Introduction: Rapeseed (Brassica napus) is cultivated as a valuable oilseed plant around the world. Knowledge of the distribution of genotypes plays an important role in determining their conservation method. Rapid Amplification Polymorphism DNA (RAPD) as an inexpensive and fast method and no need for basic genome information, is one of the most widely used molecular markers in determining phylogenetic relationships and differentiation of different animal and plant species. Materials & Methods: Twenty-five important rapeseed genotypes were collected from different parts of the country and after soil preparation; they were planted in greenhouse conditions in a completely randomized design with three replications. In order to investigate the genetic diversity, after extracting DNA from leaves, polymerase chain reaction was performed using RAPD primers. The distinct and reproducible bands of each marker were scored as either (present) or (absent). The number and percentage of polymorphic loci, Nei's genetic similarity coefficient among various material, Nei's genetic diversity index, effective number of allele and Shannon information index was then analyzed by POPGEN V1.31 software. The corresponding cluster analysis was performed using the unweight pair Group method with Arithmetic Average (UPGMA) by NTSYS V2.02 software. Results: Eighty-three polymorphic bands were amplified, the highest and lowest number of polymorphic bands were observed in primer number 6 and primers number 5 and 8, respectively. The polymorphic information content (PIC) was varied from 0.21 to 0.51 and the Nei,s genetic diversity was varied from 0.2 to 0.36. Cluster analysis using UPGMA method and Jacquard coefficient with cofenetic correlation of 0.67 divided the genotypes into three separate groups. Genotypes placed in groups 1 and 3 are spring and winter cultivars, respectively. The majority of the genotypes belongs to group2 (84%) originate from France, Germany, Australia, Iran and Serbia. The lowest genetic distance was observed between Alenso and Nataly genotypes. The principle coordinate analysis showed that the first and second components explained the 81.02% of the obtained diversity, which indicates the appropriate distribution of the studied primers on the genome. Cluster analysis using UPGMA method divided these genotypes into four separate groups. The correlation between the two traits, number of days to flowering and number of days until the emergence of the stem, was equal to 1, positive and significant at the 1% probability level. Conclusion: Since the Zorica cultivar has high seed and oil yield, this genotype can be used in crossbreeding programs with Iranian cultivars. تنوع زیستی, تجزیه خوشه ای, کلزا, نشانگر, همبستگی Cluster analysis, Genetic diversity, Principle coordinates analysis, Rapid primer, Rapeseed 59 68 http://journalaer.com/browse.php?a_code=A-10-2-62&slc_lang=fa&sid=1 Maryam Abdoli Nasab مریم عبدلی نسب m.abdolinasab@gmail.com 10031947532846001110 10031947532846001110 Yes