fa شناسایی جایگاه های ژنومی مرتبط با صفت رسیدگی جنسی ماهی قزل آلای رنگین کمان (Oncorhyncus mykiss) با استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی تخصصي Special مروری Review <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">مقدمه:</span></span></span></b> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">روش تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی مناطق ژنومی</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">در</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">مطالعات نقشه &shy;یابی صفات</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">کمی از اهمیت</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">زیادی برخوردار می&shy; باشد. این مطالعه با هدف شناسایی جایگاه &shy;های ژنومی مرتبط با صفت رسیدگی جنسی ماهی قزل &shy;آلای رنگین&shy; کمان به &shy;روش فراتحلیل داده &shy;ها انجام شد. </span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">مواد و روش</span></span></span></b><b> </b><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">ها:</span></span></span></b> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">بدین منظور اطلاعات ژنوم ماهی قزل &shy;آلای رنگین&shy; کمان برای شناسایی جایگاه&shy; های صفات کمی در بانک پایگاه&shy; های اطلاعاتی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">سپس اطلاعات مربوط به نرم&shy; افزارهای آماری مورد استفاده در نقشه &shy;یابی ارتباطی ارائه و پس از آن فرصت&shy; ها و چالش &shy;های نقشه &shy;یابی ارتباطی و مطالعات پسا نقشه &shy;یابی در سطح کل ژنوم مورد بحث قرار گرفتند. برای نقشه &shy;یابی جایگاه&shy; های صفات کمی مرتبط با یک نشانگر مولکولی، توالی نوکلئوتیدی آن نشانگر و برای نقشه &shy;یابی جایگاه&shy; های صفات کمی مرتبط با دو نشانگر مولکولی مجاور، توالی نوکلئوتیدی هر دو نشانگر مجاور یکدیگر از پایگاه &shy;های اطلاعاتی مربوطه استخراج شد. مکان &shy;یابی هر جایگاه صفت کمی براساس نقشه ژنتیکی و در سطح اطمینان 95</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">%</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">انجام و از نرم&shy;افزار </span></span><span dir="LTR" new="" roman="" style="font-family:" times="">Bio Mercator</span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">برای پیش &shy;بینی مکان و سطح اطمینان </span></span><span dir="LTR" new="" roman="" style="font-family:" times="">MQTL</span><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"> براساس روش حداکثر احتمال استفاده شد.</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">نتایج:</span></span></span></b> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">در مجموع تعداد 11 </span></span><span dir="LTR" new="" roman="" style="font-family:" times="">MQTL</span><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"> ارتباط معنی &shy;داری را نشان دادند</span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"> و </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">بیش</span></span> <span lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:">ترین تعداد جایگاه&shy; های صفات کمی شناسایی شده در گروه پیوستگی 6، 8، 12 و 13 قرار داشتند. </span></span></span></span></span></span></span><br> <b><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">بحث و نتیجه</span></span></span></span> <span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">گیری: </span></span></span></span></b><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span b="" baran="" style="font-family:">نتایج نشان داد که جایگاه &shy;های صفات کمی هم مکان برای صفت مورد مطالعه وجود دارند که می &shy;توانند در به &shy;نژادی و مهندسی ژنتیک ماهی قزل &shy;آلای رنگین &shy;کمان به</span></span></span>&nbsp;<span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span b="" baran="" style="font-family:">کار روند.</span></span></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif"><span style="color:black">Introduction: </span></span></b><span lang="EN" style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif">The method of bioinformatic analysis of genomic regions is very important in quantitative trait mapping studies. This study was conducted with the aim of identifying the genomic loci related to the sexual maturation trait of rainbow trout by data meta analysis method.</span></span></span></span></div> <p style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;"><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif"><span style="color:black">Materials & Methods:</span></span></span></b> <span lang="EN" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif">For this purpose, the genome information of rainbow trout was analyzed to identify the locations of quantitative traits in the database. Then, the information related to the statistical software used in linkage mapping was presented, and then the opportunities and challenges of linkage mapping and post-mapping studies at the whole genome level were discussed. To map the locations of quantitative traits related to a molecular marker, the nucleotide sequence of that marker and to map the locations of quantitative traits related to two adjacent molecular markers, the nucleotide sequence of both adjacent markers was extracted from the respective databases.</span></span> <span lang="EN" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif">The location of each quantitative trait locus was done based on the genetic map and at a 95% confidence level, and Biomercator software was used to predict the location and confidence level of MQTL based on the maximum likelihood method.</span></span><span lang="EN" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif"></span></span></span></span></p> <p style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="font-family:&quot;Courier New&quot;"><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif"><span style="color:black">Result: </span></span></span></b><span lang="EN" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif">In total, the number of 11 MQTLs showed a significant relationship, and the highest number of identified quantitative trait loci were in the 6th, 8th, 12th, and 13th linkage groups. </span></span></span></span></p> <p style="text-align: justify;"><b><span style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif"><span style="color:black">Conclusion:</span></span></span></span></b> <span lang="EN" style="font-size:11.0pt"><span style="line-height:107%"><span style="font-family:&quot;Times New Roman&quot;,serif">The results showed that there are few trait loci for the studied trait that can be used in breeding and genetic engineering of rainbow trout.</span></span></span></p> بیوانفورماتیک, ژنوم, رسیدگی جنسی, قزل آلای رنگین کمان, QTL Bioinformatics, Genome, Sexual maturation, Rainbow trout, QTL 93 104 http://journalaer.com/browse.php?a_code=A-10-2-26&slc_lang=fa&sid=1 Saltanat Najjar Lashgari سلطنت نجارلشگری se_lashgari@yahoo.com 10031947532846001392 10031947532846001392 Yes Sajjad Nazari سجاد نظری 10031947532846001393 10031947532846001393 No Shirin Jamshidi شیرین جمشیدی 10031947532846001394 10031947532846001394 No