Journal of Animal Environmental Research
پژوهش های محیط زیست جانوری
Journalaer
Basic Sciences
http://journalaer.com
1
admin
3115-7904
10.22034/aer
fa
jalali
1404
9
1
gregorian
2025
12
1
1
4
online
1
fulltext
fa
برازش شبکه برهمکنش پروتئین های مؤثر بر باروری گاوشیری بر اساس دادههای بیان ژن
Fit protein interaction network based on gene expression data for dairy cattle fertilit
عمومى
General
پژوهشي
Research
<div>
<table align="center" hspace="0" vspace="0">
<tbody>
<tr>
<td style="padding: 0in 12px; text-align: justify;" valign="top"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="punctuation-wrap:simple"><span style="text-autospace:none"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">مقدمه:</span></span></span></b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> صفات تولیدمثلی در صنعت دامپروری از اهمیت بالایی برخوردار است که این اهمیت بهمرورزمان در حال افزایش است. این اهمیت به</span></span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">دلیل تأثیر مستقیمی است که این صفات بر سودآوری واحدهای دامپروری دارند و این مسئله روزبهروز موردتوجه بیش</span></span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">تری قرار میگیرند. نرخ باروری یکی از صفات مهم در حوزه دامداری است که به توانایی یک دام در تولید نسل و نسل جدید اشاره دارد. برای تولیدکنندگان دام، نرخ باروری اهمیت زیادی دارد، زیرا افزایش این نرخ باعث بهبود در میزان تولید و بهرهوری واحد دامپروری می ­شود. در زمینه دانش بیوانفورماتیک، یافتن ژنها در میان توالیهای ژنومی از اهمیت به</span></span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">سزایی برخوردار است. ژنها واحد اصلی و اساسی وراثت هستند و اطلاعات مربوط به ساختار و عملکرد سلولها و ارگانیسمها را در خود جایدادهاند. این مطالعه باهدف بررسی شبکه برهمکنش پروتئین</span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">­</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">های مؤثر بر باروری گاوشیری بر اساس دادههای بیان ژن اجراشده است.</span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br>
<span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="punctuation-wrap:simple"><span style="text-autospace:none"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">مواد و روش ­ها:</span></span></span></b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> برای بررسی سازوکارهای اثر ریز ریبونوکلئیک اسیدها بر</span></span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">خصوصیت باروری، از طریق دادهکاوی ناحیه ژنها، به جستجوی ژن جدید و سازوکار احتمالی مرتبط با صفت مزبور در گاو پرداخته شد. ژنهای</span></span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">مرتبط با باروری در</span></span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">گاو، از پایگاه اطلاعاتی </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">NCBI</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> جستجو شد، سپس توسط </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">GEO2R</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> و با استفاده از نرمافزار </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">R</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> نتایج، تجزیهوتحلیل گردید و پس از آن، شبکه بین ژنی، توسط پایگاه اطلاعاتی </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">String</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> ایجاد گردید. هم</span></span></span> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">چنین از پایگاه </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">DAVID</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> برای مطالعه بیولوژیکی ژنها، استفاده شد و در پایان، ارتباط بهدستآمده، توسط نرمافزار </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">Cytoscape</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> مجسم سازی شد.</span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black"></span></span></span></span></span></span></span></span></span></span><br>
<span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">نتایج:</span></span></span></b><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> یافتههای این تحقیق نشان دادهاند که ژنهای زیادی ازجمله </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">CDK1</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">PPP2R3C</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">NDC80</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">ENY2</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">WDR12</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">MRPL27</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">LAPTM5</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">C1QB</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">، </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">MCM5</span></span></span><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> و </span></span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">TPX2</span></span></span><span style="font-size:12.0pt"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black"> توسط مسیرهای بیولوژیکی مختلف در بافت آندومتریم اثر میگذارند. این اثرات میتوانند به طرق مختلفی بر باروری حیوانات تأثیر بگذارند و از این طریق به بهبود عملکرد تولیدی آنها کمک کنند و بهعبارتدیگر، ژنهای موردبررسی توانمندند که از طریق مسیرهای بیولوژیکی در بافت آندومتریم دیوار رحم تنظیم شوند و درنتیجه، بر اموری مانند باروری حیوانات تأثیرگذار باشند.</span></span></span></span></span></span></span></span></td>
</tr>
</tbody>
</table>
</div>
<div style="text-align: justify;"><span class="MsoPlaceholderText" style="color:gray"><b><span dir="RTL" lang="AR-SA" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">بحث و نتیجه ­گیری: </span></span></span></span></b></span><span dir="RTL" lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span style="line-height:107%"><span b="" baran="" style="font-family:"><span style="color:black">این مطالعه ممکن است به دامداران این امکان را بدهد تا استراتژیهای بهینهتری را برای بهبود باروری حیوانات اجرا کنند.</span></span></span></span></div>
باروری گاوشیری, بیان ژن, پروتئینهای مؤثر, شبکه برهمکنش, شبکه ژنی
1
12
http://journalaer.com/browse.php?a_code=A-10-1-2&slc_lang=fa&sid=1
Seyyed Homayoun
Farhangfar
سید همایون
فرهنگ فر
1003194753284600108
1003194753284600108
No
Mahdi
Zeya
مهدی
ضیاء
mzeya1993@gmail.com
1003194753284600109
1003194753284600109
Yes
Elham
Behdani
الهام
بهدانی
1003194753284600110
1003194753284600110
No
Mohamadbagher
Montazertorbati
محمدباقر
منتظرتربتی
1003194753284600111
1003194753284600111
No