|
بررسی ژنوم میتوکندریایی به روش PCR-RFLP در جمعیت های گونه های آرتمیا (Leach, 1819) در ایران
|
محبوبه حاجی رستملو*   ، سهراب رضوانی گیل کلایی ، سیدمحمدرضا فاطمی ، مجید صادقی زاده |
|
|
|
چکیده: (10 مشاهده) |
مقدمه: آرتمیا یا میگوی آب شور سخت پوست کوچکی است که در بخشهای مختلفی از جهان جز در قطب شمال دیده می شود. این تحقیق با توجه به اهمیت مطالعات مولکولی در شناسایی جمعیت های یک گونه و تنوع ژنتیکی موجود در اشکال دو جنسی و بکرزای آرتمیا (با هم و در بین جمعیتها) صورت پذیرفت.
مواد و روش ها: نمونه برداری آرتمیا از 9 منطقه (دریاچههای شور، اینچه برون، نمک، حوض سلطان، میقان، مهارلو، بختگان، ارومیه و نوغ) انجام و 315 نمونه مورد استخراج DNA به روش فنل کلروفرم صورت گرفت. پرایمرها براساس توالی ژن ریبوزومال میتوکندری آرتمیا، طراحی و PCR صورت پذیرفت. هضم آنزیمی محصول PCR با 10 آنزیم (AluI, Eco47I, HaeIII, HindIII, HinfI, MobI, MspI, RsaI, TaqI, EcoRI) انجام گردید. پس از شناسایی ژنوتیپ ها و محاسبه هاپلوتیپ ها، تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی درون جمعیتی، تنوع و اختلاف نوکلئوتیدی بین جمعیت و فاصله ژنتیکی میان هاپلوتیپ ها با نرم افزار Reap آنالیز و فراوانی ناهمگنی جغرافیایی هاپلوتیپ ها با آزمون مربع کای و شبیه سازی Monte-Carlo محاسبه گردیدند.
نتایج: این مطالعه وجود 25 هاپلوتیپ متفاوت شامل 9 هاپلوتیپ در ارومیه، 4 در شور و اینچه برون، 4 در نوغ، 1 در نمک و حوض سلطان، 3 در میقان، 1 مشترکاً در بختگان و مهارلو و3 در مهارلو را نشان داد. کم ترین تنوع هاپلوتیپی درون نمونه ها در حوض سلطان، نمک و بختگان و حداکثر مقدار آن در مهارلو دیده شد. کم ترین میزان تنوع نوکلئوتیدی درون نمونه ها متعلق به حوض سلطان، نمک و بختگان و بیش ترین متعلق به ارومیه بود. در میزان تنوع نوکلئوتیدی بین نمونه ها کم ترین مقدار بین حوض سلطان با نمک و بیش ترین مقدار بین اینچه برون و شور با نوغ مشاهده شد. اختلاف نوکلئوتیدی بین نمونه ها نیز برای اینچه برون با شور کم ترین و برای اینچه برون و شور با نوغ بیش ترین مقدار به دست آمد. در فاصله تکاملی بین هاپلوتیپ ها بیش ترین مقدار به هاپلوتیپ های نوغ و میقان با هاپلوتیپ های اینچه برون و شور متعلق بود.
بحث و نتیجه گیری: بررسی جدایی جمعیت ها براساس فراوانی هاپلوتیپ ها تفاوت آماری معنی داری را به جز در مقایسه حوض سلطان با نمک و اینچه برون با شورنشان داد (0/001>p) و در سطح هاپلوتیپی امکان تفکیک جمعیتی آرتمیا در ایران به 7 جمعیت حوض سلطان- نمک، میقان، مهارلو، بختگان، نوغ، ارومیه و اینچه برون - شور فراهم گردید. |
|
| واژههای کلیدی: آرتمیا، mtDNA، RFLP، تنوع ژنتیکی، ایران |
|
|
متن کامل [PDF 902 kb]
(6 دریافت)
|
نوع مطالعه: كاربردي |
موضوع مقاله:
تخصصي
دریافت: 1404/10/9 | پذیرش: 1404/11/10
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
