|
ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه بندی ارقام کلزا با نشانگرهای مولکولی و صفات رشدی
|
مریم عبدلی نسب*   |
|
|
|
چکیده: (42 مشاهده) |
مقدمه: کلزا (Brassica napus) به عنوان یک گیاه دانه روغنی با ارزش در سراسر جهان کشت میشود آگاهی از پراکندگی ژنوتیپ ها در تعیین روش حفاظت آن ها نقش مهمی ایفا می کند. نشانگرRAPD به عنوان یک روش ارزان و سریع و بدون نیاز به اطلاعات اولیه ژنوم، یکی از پرکاربردترین نشانگرهای مولکولی در تعیین روابط فیلوژنتیکی و تمایز گونه های مختلف جانوری و گیاهی می باشد.
مواد و روش ها: تعداد ۲۵ ژنوتیپ مهم کلزا مورد کشت در مناطق مختلف کشور پس از آمادهسازی خاک، در شرایط گلخانه در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار کشت شدند. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و پس از استخراج DNA از برگ واکنش زنجیرهای پلیمراز با آغازگرهای RAPD انجام گردید. تعداد و درصد جایگاههای چندشکلی، ضریب تشابه ژنتیکیNei ، شاخص تنوع ژنتیکی، تعداد آلل موثر و شاخص اطلاعات شانون توسط نرمافزار POPGEN V1.31 و تجزیه و تحلیل خوشه ای توسط نرم افزار NTSYS V2.02 مورد ارزیابی قرار گرفت. تجزیه واریانس تعداد 16 شاخص رشدی اندازه گیری شده و مقایسه میانگین داده ها، همبستگی بین صفات، تجزیه خوشه ای و محاسبه ضریب کوفنتیک با نرم افزارهای V.9.4 SAS،SPSS V. 22 و NTYSIS صورت گرفت.
نتایج: تعداد 83 باند چندشکل تکثیر شد، بیش ترین و کم ترین تعداد باند چند شکل به ترتیب در آغازگر شماره 6 و آغازگرهای شماره 5 و 8 مشاهده گردیدند. محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) از 0/21 تا 0/5 و میزان تنوع ژنتیکی نی از 0/2 تا 0/36 متغیر بود. تجزیه خوشهای به روش UPGMA و ضریب جاکارد با همبستگی کوفنتیک 0/67 ژنوتیپ ها را در سه گروه مجزا قرارداد. ژنوتیپ های قرار گرفته در گروه یک و سه به ترتیب ارقام بهاره و زمستانه می باشند. اکثریت ارقام قرار گرفته در گروه دوم (84 درصد) با منشا فرانسه، آلمان، استرالیا، ایران و صربستان می باشند. کم ترین فاصله ژنتیکی بین ژنوتیپهای آلنسو و ناتالی مشاهده گردید. تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که مؤلفه اول و دوم 81/02 درصد از تنوع به دست آمده را توجیه می کنند، که نشان دهنده توزیع مناسب آغازگرهای مورد بررسی بر روی ژنوم میباشد. تجزیه خوشه ای به روش UPGMA، این ژنوتیپ ها را به چهار گروه مجزا تقسیم نمود. همبستگی بین دو صفت تعداد روز تا گلدهی و تعداد روز تا ساقه دهی برابر ۱، مثبت و در سطح احتمال ۱ درصد معنی دار بود.
بحث و نتیجه گیری: از آن جاکه رقم زوریکا عملکرد دانه و روغن بالا دارد می توان از این ژنوتیپ در برنامه های تلاقی با ارقام ایرانی استفاده کرد. |
|
| واژههای کلیدی: تنوع زیستی، تجزیه خوشه ای، کلزا، نشانگر، همبستگی |
|
|
متن کامل [PDF 1202 kb]
(17 دریافت)
|
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
تخصصي
دریافت: 1405/3/6 | پذیرش: 1404/5/10 | انتشار: 1404/5/10
|
|
|
|
|
|
|
| ارسال پیام به نویسنده مسئول |
|
|
|
| ارسال نظر درباره این مقاله |
|
|
|
