[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
اطلاعات نشریه::
آرشیو مجله و مقالات::
برای نویسندگان::
برای داوران::
ثبت نام و اشتراک::
تماس با ما::
تسهیلات پایگاه::
بایگانی مقالات زیر چاپ::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
..
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
..
پایگاه های نمایه شده




..
:: دوره 1، شماره 2 - ( 5-1404 ) ::
جلد 1 شماره 2 صفحات 68-59 برگشت به فهرست نسخه ها
ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه بندی ارقام کلزا با نشانگرهای مولکولی و صفات رشدی
مریم عبدلی نسب*
چکیده:   (531 مشاهده)
مقدمه: کلزا (Brassica napus) به عنوان یک گیاه دانه روغنی با ارزش در سراسر جهان کشت می­شود آگاهی از پراکندگی ژنوتیپ ­ها در تعیین روش حفاظت آن ها نقش مهمی ایفا می ­کند. نشانگرRAPD  به عنوان یک روش ارزان و سریع و بدون نیاز به اطلاعات اولیه ژنوم، یکی از پرکاربردترین نشانگرهای مولکولی در تعیین روابط فیلوژنتیکی و تمایز گونه­ های مختلف جانوری و گیاهی می­ باشد.
مواد و روش­ ها: تعداد ۲۵ ژنوتیپ مهم کلزا مورد کشت در مناطق مختلف کشور پس از آماده­سازی خاک، در شرایط گلخانه در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار کشت شدند. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و پس از استخراج DNA از برگ واکنش زنجیره­ای پلیمراز با آغازگرهای RAPD انجام گردید. تعداد و درصد جایگاه‌های چندشکلی، ضریب تشابه ژنتیکیNei ، شاخص تنوع ژنتیکی، تعداد آلل موثر و شاخص اطلاعات شانون توسط نرم‌افزار POPGEN V1.31 و تجزیه و تحلیل خوشه­ ای توسط نرم افزار NTSYS V2.02 مورد ارزیابی قرار گرفت. تجزیه واریانس تعداد 16 شاخص رشدی اندازه ­گیری شده و مقایسه میانگین داده­ ها، همبستگی بین صفات، تجزیه خوشه ­ای و محاسبه ضریب کوفنتیک با نرم افزارهای V.9.4 SAS،SPSS V. 22 و NTYSIS صورت گرفت.
نتایج: تعداد 83 باند چندشکل تکثیر شد، بیش ترین و کم ترین تعداد باند چند شکل به ترتیب در آغازگر شماره 6 و آغازگرهای شماره 5 و 8  مشاهده گردیدند. محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) از 0/21 تا 0/5 و میزان تنوع ژنتیکی نی از 0/2 تا 0/36 متغیر بود. تجزیه خوشه­ای به روش UPGMA و ضریب جاکارد با همبستگی کوفنتیک 0/67 ژنوتیپ ­ها را در سه گروه مجزا قرارداد. ژنوتیپ های قرار گرفته در گروه یک  و سه به ترتیب ارقام بهاره و زمستانه می­ باشند. اکثریت ارقام قرار گرفته در گروه دوم (84 درصد) با منشا فرانسه، آلمان، استرالیا، ایران و صربستان می ­باشند. کم ترین فاصله ژنتیکی بین ژنوتیپ­های آلنسو و ناتالی مشاهده گردید. تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که مؤلفه اول و دوم 81/02 درصد از تنوع به دست آمده را توجیه می ­کنند، که نشان­ دهنده توزیع مناسب آغازگرهای مورد بررسی بر روی ژنوم می­باشد. تجزیه خوشه ­ای به روش UPGMA، این ژنوتیپ ­ها را به چهار گروه مجزا تقسیم نمود. همبستگی بین دو صفت تعداد روز تا گل­دهی و تعداد روز تا ساقه ­دهی برابر ۱، مثبت و در سطح احتمال ۱ درصد معنی­ دار بود.
بحث و نتیجه­ گیری: از آن جاکه رقم زوریکا عملکرد دانه و روغن بالا دارد می­ توان از این ژنوتیپ در برنامه ­های تلاقی با ارقام ایرانی استفاده کرد.
واژه‌های کلیدی: تنوع زیستی، تجزیه خوشه ای، کلزا، نشانگر، همبستگی
متن کامل [PDF 1202 kb]   (170 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
فهرست منابع
1. 1. Channa, S.A., Tian, H., Wu, Q. and Hu, S.W., 2016. Analysis of genetic diversity among rapeseed cultivar and breeding lines by SRAP molecular markers. Pakistan Journal of Botany. 48(6): 2409-2422.
2. 2. Wang, H.Z. and Yin, Y., 2014. Analysis and strategy for oil crop industry in China. Chinese Journal of Oil Crop Science. 36: 414-442.
3. 3. Moradbeigi, L., Gholami, A., Shirani-Rad, A.H., Abbasdokht, H. and Asghari, H.R., 2019. Effect of Drought Stress and Delay Cultivation on Grain Yield, Oil Yield and Fatty Acids Composition in Canola. Agricultural Science and Sustainable Production. 29(2): 135-151. (In Persian)
4. 4. Soltani Gishini, M.F., Zebarjadi, A., Abdoli Nasab, M., Jalali Javaran, M., Kahrizi, D. and Hildebrand, D., 2019. Endoplasmic reticulum retention signaling and transmembrane channel proteins predicted for oilseed ω3 fatty acid desaturase 3 (FAD3) genes. Functional and Integrative Genomics. 20(3):433-458. doi: 10.1007/ s10142-019-00718-8
5. 5. FAO. 2019. http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC/ visualize
6. 6. Moradi, M. and Soltani Howyzeh, M., 2018. Evaluation of genetic diversity and heritability of the grain yield and yield components in spring rapeseed cultivars. Journal of Crop Breeding. 10(26): 207-214. doi: 10.29252/jcb.10.26.207 (In Persian)
7. 7. Imani Harsini, J., Rezaei, H.R., Naderi, S. and Varasteh Moradi, H., 2015. Surveying the structure and genetic diversity of red foxes in the North East of Iran, based on cytochrome b gene. Journal of Animal Environment. 4: 25-34. (In Persian)
8. 8. Belletti, P., Monteleone, I. and Ferrazzini, D., 2008. A population genetic study in a scattered forest species, Wild service tree [Sorbus torminalis (L.) crantz], using RAPD markers. European Journal of Forest Research. 127(2): 103-114. doi: 10.1007/s10342-007-0187-1
9. 9. Girke, A., Schierholt, A. and Becker, H.C., 2012. Extending the rapeseed gene pool with resynthesized Brassica napus napus II: Heterosis. Theoretical and Applied Genetics. 124(6):1017-1026. doi: 10.1007/s001 22-011-1765-7
10. 10. Ghahari, J. and Mahmoodi, Sh., 2021. Assessment of genetic structure of common buzzard species in East Azerbaijan using PCR-RAPD Markers. Journal of Animal Environment. 13(1): 119-128. doi: 10.22034/aej. 2020.132966 (In Persian)
11. 11. Naghavi, M.R., Ghareyazi, B. and Hoseini Salkadeh, G., 2007. Molecular markers. Tehran University, Iran. 350 p. (In Persian)
12. 12. Safari, S. and Mehrabi, A.A., 2017. Genetic Relationships of Rapeseed Cultivars Revealed by RAPD Markers. Journal of Crop Breeding. 8 (19) :177-170. dor: 20.1001.1.22286128.1395.8.19.14.9 (In Persian)
13. 13. Havlickova, L., Jozova, E., Rychla, A., Klima, M., Kucera, V. and Curn, V., 2014. Genetic diversity assessment in winter oilseed rape (Brassica napus L.) Collection using AFLP, ISSR and SSR markers. Czech Journal Genet Plant Breed. 50(3): 216-225. doi: 10. 17221/220/2013-CJGPB
14. 14. Mirzaei Delbari, A., Noryazdan, H., Vatandoost, J., Bayat Shahparast, F. and Armin, M., 2017. Evaluation of genetic variation in some canola cultivars using ISSR markers. Biotechnology in Agriculture. 16(2): 73-80. (In Persian)
15. 15. Murray M.G. and Thampson, W.F., 1980. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acid Research. 8(19): 4321-4325. doi: 10.1093/nar/8. 19.4321
16. 16. Nei, M., 1972. Genetic distance between populations. The American Naturalist. 106(949): 283-292. doi: 10. 1086/282771
17. 17. Jobson, J.D., 1992. Applied Multivariate Data Analysis. © Springer-Verlag New York, IncChapter 10; Cluster analysis and multidimensional scaling. 483-616.
18. 18. Lincoln, S.E., Daly, M.J. and Lander, E.S., 1993. Constructing genetic maps with Mapmaker/Exp version 3.0, a tutorial and reference manual. In: Whitehead Inst. Biomed Res. Tech. Rpt. (3rd ed). Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge.
19. 19. Zhou, R., Wu, Z., Cao, X. and Jiang, F., 2015. Genetic diversity of cultivated and wild tomatoes revealed by morphological traits and SSR markers. Genetics and Molecular Research. 14(4): 13868-13879. doi: 10.4238/2015.October.29.7
20. 20. Rabiee, B. and Rahimi, M., 2009. Evaluation of grouping methods of rapeseed genotypes using Fisher linear detection function analysis. Journal of Science and Technology of Agriculture and Natural Resources. 13(47): 529-542. (In Persian)
21. 21. Shokrpour, M., Abedi, Z., Kalantari, S. and Salami, S.A., 2016. Study of genetic variation in some Iranian saffron accessions using molecular markers of RAPD and ISSR. Saffron Agronomy & Technology. 4(4):
22. 257-265. dor: 20.1001.1.23831529.1395.4.4.1.9 (In Persian)
23. 22. Darvish Nia, D.F., Fakheri, B.A., Nazarian, F.F. and Panjehkeh, N., 2015. Genetic diversity of rapeseed (Brassica napus L.) using SSR and ISJ molecular markers. Iranian Journal of Field Crop Science. 46(1):
24. 1-14. doi: 10.22059/ijfcs.2015.54041 (In Persian)
25. 23. Eyni Nargeseh, H.E., Aghaalikhani, M., Rad, A.H., Mokhtasi-Bidgoli, A. and Sanavy, S.A., 2019. Response of new genotypes of rapeseed (Brassica napus L.) to late season with holding irrigation under semi-arid climate. Journal of Plant Production. 41(4): 55-68. https://doi.org/10.22055/ppd.2018.22672.1491 (In Persian)
26. 24. Ehteshami, S.M, Tehrani Aref, A. and Samadi, B., 2014. Effect of planting date on some phenological and morphological characteristics, yield and yield components of five rapeseed (Brassica napus L.) cultivars. Agronomy Journal (Pajouhesh & Sazandegi). 109: 111-120. (In Persian)
27. 25. Mostafavi rad, M. and Hazavaei, M.A., 2010. The effect of seed amount on important agronomic traits in three varieties of winter canola. Iranian Journal of Field Crop Science. 41(4): 685-697. dor: 20.1001.1.20084811. 1389.41.4.5.0 (In Persian)
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Abdoli Nasab M. Evaluation of Genetic Diversity and Grouping of Rapeseed Cultivars using Molecular Markers. , Journalaer. 2025; 1 (2) :59-68
URL: http://journalaer.com/article-1-132-fa.html

عبدلی نسب مریم. ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه بندی ارقام کلزا با نشانگرهای مولکولی و صفات رشدی. , پژوهش های محیط زیست جانوری. 1404; 1 (2) :59-68

URL: http://journalaer.com/article-1-132-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 1، شماره 2 - ( 5-1404 ) برگشت به فهرست نسخه ها
پژوهش های محیط زیست جانوری Journal of Animal Environmental Research
Persian site map - English site map - Created in 0.17 seconds with 37 queries by YEKTAWEB 4780